Acido nucleico « Chiroblog

Archive pour la catégorie ‘Acides nucléiques

Convergenza evolutiva (4) : jusque dans les molécules !

Sabato 27 Aprile 2013

Un quatrième épisode vient s’ajouter à cette série dédiée aux convergences évolutives. Dans les épisodes précédents, nous avons vu que les convergences sont des acquisitions parallèles de structures similaires dans des lignées évolutives différentes mais soumises à des conditions environnementales équivalentes. Nous avons vu des exemples de convergences écomorphologiques (écologie + morfologia) comme chez les chauves-souris pêcheuses, il Myotis et chez les chauves-souris nectarivores de la famille des Phyllostomidae. Plus impressionnant encore, les convergences peuvent exister au niveau moléculaire ! C’est ce qu’ont découvert des chercheurs américains et chinois chez les Cétacés (plus précisément chez les baleines à dents ou Odontocètes) e Microchiroptères*, qui utilisent les ultrasons par le mécanisme d’ecolocalizzazione (= biosonar) pour se diriger et chasser. Le gène codant pour la prestine, protéine utilisée pour l’audition et l’amplification des sons, montre chez ces animaux un mécanisme moléculaire très similaire (Li et al. 2008 & 2010, Jones 2010, Liu et al. 2010).

Così, les exemples de convergences se multiplient dans la littérature et la poursuite des travaux dans ce domaine promet encore de nombreuses découvertes tout aussi intéressantes sur l’évolution de la vie.

Yann pour le Chiroblog

Microchiroptères* : Deux sous-ordres étaient classiquement admis : il Microchiroptères (de petite taille relative et capables d’écholocation) e Mégachiroptères (de grande taille relative ; Dobson 1875). Récemment, l’ordre a été redécoupé en deux nouveaux sous-ordres pour rompre la paraphylie des Microchiroptères : il Yinpterochiroptera e Yangochiroptera (Teeling et al. 2002 ; Teeling et al. 2005).

Riferimenti :

Jones, G. (2010). Molecular evolution: gene convergence in echolocating mammals. Current biology : CB, 20(2), R62–4. due:10.1016/j.cub.2009.11.059

Li, G., Wang, J., Rossiter, S. J., Jones, G., Cotton, J. A., & Zhang, S. (2008). The hearing gene Prestin reunites echolocating bats. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105(37), 13959–64. due:10.1073/pnas.0802097105

Li, Y., Liu, Z., Shi, P., & Zhang, J. (2010). The hearing gene Prestin unites echolocating bats and whales. Current biology : CB, 20(2), R55–6. due:10.1016/j.cub.2009.11.042

Liu, Y., Cotton, J. A., Shen, B., Han, X., Rossiter, S. J., & Zhang, S. (2010). Convergent sequence evolution between echolocating bats and dolphins. Current biology : CB, 20(2), R53–4. due:10.1016/j.cub.2009.11.058

Teeling, E. C., Il. Madsen, R. A. Van den Bussche, W. In. de Jong, M. J. Stanhope et M. S. Springer. 2002. Microbat paraphyly and the convergent evolution of a key innovation in Old World rhinolophoid microbats. Atti della National Academy of Sciences, Stati Uniti d'America 99: 1431-1436.

Teeling, E. C., M. S. Springer, Il. Madsen, P. Bates, J. O’Brien S et W. J. Murphy. 2005. A molecular phylogeny for bats illuminates biogeography and the fossil record. Science 307: 580-584.

Notizie di ottobre 2012

Venerdì 5 Ottobre 2012

Una nuova selezione di articoli scientifici per il mese di ottobre 2012 :

- Un articolo che risolve un mistero 65 anni durante i quali abbiamo capito solo una copia del Paracoelops megalotis, un piccolo pipistrello della famiglia riuniti a Hipposidéridés 1947 au Vietnam. Persona non era mai stato in grado di catturare un'altra copia del caso che è un unico tipo. Un riesame del campione tipo di Paracoelops megalotisdéceller ha errori significativi nella descrizione e confronto con pipistrelli catturati recentemente in Vietnam ha portato alla conclusione che il caso non era altro che Hipposideros pomona, specie relativamente comuni nel Sud-Est asiatico [scarica il PDF].

- Una nuova filogenesi del Murine (Myotis) America centrale e tropicale è stato pubblicato nella Gazzetta Plos One
[scarica il PDF]. Sulla base di molecolare, tre nuove linee nt stata descritta, è in aggiunta a 15 già noto.

- Un articolo pubblicato sul Canadian Journal of Zoology evidenzia l'ibridazione può
tra le specie Pipistrellus pipistrellus e P. pygmaeus [link al sommario].

- Un articolo che evidenzia l'apprendimento di segnali acustici in Emballonuridae specifici gruppi Saccopteryx bilineata, utile per il riconoscimento tra gli individui [link al sommario]

La squadra Chiroblog

Riferimenti


- Perizoma V.D., C. Dietz, Denzinger A., Bates P.J.J., Puechmaille S.J., Callou C. Schnitzler e H-U. (2012). Risoluzione di un mistero mammifero: l'identità Paracoelops megalotis (Chiroptera: Hipposideridae). Zootaxa, 3505, 75-85.

- Knörnschild, M., Nagy, M., Metz, M., Mayer, F., & von Helversen, Il. (2012). Apprese le firme dei gruppi vocali nella pipistrello poligami Saccopteryx bilineata. Comportamento animale, 84(4), 761-769. due:10.1016/j.anbehav.2012.06.029

- Larsen RJ, Pulsante MC, Genoways HH, Khan FAA, Larsen PA, et al. (2012) Diversità genetica di Neotropicale Myotis (Chiroptera: Vespertilionidae) Con l'accento sulla specie sudamericana. PLoS ONE 7(10): e46578. due:10.1371/journal.pone.0046578

- Sztencel-Jabłonka, A., & Bogdanowicz, In. (2012). Popolazione studio di genetica comune (Pipistrellus pipistrellus ) e soprano (Pipistrellus pygmaeus) pipistrello pipistrelli dall'Europa centrale suggerisce ibridazione interspecifica. Canadian Journal of Zoology, 90(10), 1251-1260. due:10.1139/Z2012-092

News nel maggio 2012

Martedì 15 Maggio 2012

Una nuova selezione di articoli scientifici per il mese di maggio 2012 :

- Un articolo pubblicato nel PloS One che si sviluppa l'uso di DNA minibarcodes
per rilevare la dieta di montagna murino Plecotus macrobullaris [link al astratta e PDF].

- Una nuova classificazione del mondo famiglia Emballonuridae Vecchio
pubblicato Phylogenetics molecolare e sviluppo [link al sommario].

- Una nuova specie di Sesso Hipposideros appena descritto e il suo nome, Hipposideros Griffini rend omaggio au Professeur Donald Redfield Griffin (1915-2003) che ha avviato ricerche approfondite sulla ecolocalizzazione nei pipistrelli [link al sommario].

-Gruppo di classificazione 'turpis’ in Hipposideros basta essere rivisto con i due principali sottospecie elevati a specie pieni e una sottospecie di nuove descritto [collegamento in PDF].

- Un articolo pubblicato nel La natura delle comunicazioni definire la notevole varietà diParamyxoviridaenei pipistrelli (e roditori) [scarica la comunicazione]. Come altre famiglie virali (ilCoronaviridae per esempio) il Paramyxoviridae, comprendente la generi Henipavirus (Virus Nipah e Hendra), ma ancheRubulavirus (virus della parotite: “parotite”) eMorbillivirus (virus del morbillo, si virus della febbre-da-piccoli ruminanti) hanno diversificato in più gruppi di mammiferi e in particolare in gruppi di grandi dimensioni come roditori e pipistrelli. Andremo più in dettaglio questo articolo in un post futuro.

In caso contrario, Vi ricordiamo 3° Incontri Internazionali pipistrelli Berlin e la Bat Distribuzione Viewerche permette di visualizzare le mappe di distribuzione delle specie di pipistrelli in tutto il mondo.

La squadra Chiroblog

Riferimenti

- Alberdi, A., Garin, I., Aizpurua, O., & Aihartza, J. (2012). Il foraggiamento di Ecologia del Long-Eared macrobullaris Bat Mountain Plecotus rivelato con DNA Mini-codici a barre. PLoS ONE, 7(4), e35692.

- Ruedi, M., Friedli-Weyeneth, N., Teeling, E. C., Puechmaille, S. J., & Goodman, S. M. (2012). Biogeografia di Old World emballonurine pipistrelli (Chiroptera: Emballonuridae) dedotto con DNA mitocondriale e nucleare. Filogenesi molecolare ed evoluzione, 64(1), 211-204. due:10.1016/j.ympev.2012.03.019

- Laccio, V.D., Puechmaille S.J., Denzinger A., Csorba G., C. Dietz, Bates P.J.J., Teeling E.C. Schnitzler e H-U. (2012). Una nuova specie di Hipposideros (Chiroptera: Hipposideridae) dal Vietnam. Journal of Mammalogy, 93(1), 1-11.

-Laccio, V.D., Puechmaille S.J., Denzinger A., Bates P.J.J., C. Dietz, Csorba G., Soisook P., Teeling E.C., Matsumura S., Furey N. Schnitzler e H-U. (2012). Sistematica del Hipposideros turpis complesso con una descrizione di una nuova sottospecie dal Vietnam. Mammal Review, 42(2), 166-192.

- Drexler, J. F., Corman, In. M., Mugnaio, M. A., Maganga, G. D., Vallo, P., Binger, T., Gloza rumore,F.., et al. (2012). Bats ospitanti paramyxoviruses grandi mammiferi. Nature Communications, 3, 796.

News a marzo 2012

Lunedi 19 Marzo 2012

Una nuova selezione di articoli scientifici per il mese di marzo 2012 :

- Una nuova classificazione del Molossinae sottofamiglia (Molossidae) comprendente l'analisi
Carattere molecolare, è appena stato pubblicato nella Journal of Mammalogy [scarica il PDF].

- Una nuova filogenesi del Murine (Myotis) Caribbean è stato pubblicato sulla rivista Biologia dei mammiferi
[link al sommario]. Sulla base morfologica e molecolare, una terza specie endemiche ai Caraibi è stato scoperto.

- Un articolo pubblicato su PLoS One relazioni sull'uso delle sostanze chimiche, les isotopi stalle,
come metodo per prevedere il sito di riproduzione di europeo pipistrelli
[link al astratta e PDF].

La squadra Chiroblog

Riferimenti

- Ammerman, Il. K., Sottovento, D. N., & Suggerimenti, T. M. (2012). I primi approfondimenti filogenetici molecolari nella evoluzione della free-coda pipistrelli nel Molossinae sottofamiglia (Molossidae, Chiroptera). Journal of Mammalogy, 93(1), 12-28. due:10.1644/11-MAMM-A-103,1

- Larsen, R. J., Larsen, P. A., Genoways, H. H., Catzeflis, F. M., Geluso, K., Kwiecinski, G. G., Pedersen, S. C., et al. (2012). Storia evolutiva delle specie Myotis dei Caraibi, con evidenza di un terzo delle Antille Lesser endemica. Biologia dei mammiferi – Journal of Mammalogy, 77(2), 124-134. due:10.1016/j.mambio.2011.11.003

- Popa-Lisseanu, A. G., Soergel, K., Luckner, A., Wassenaar, Il. I., Ibanez, C., Kramer-Schadt, S., Ciechanowski, M., et al. (2012). Un approccio triple-isotopo per predire le origini di allevamento di pipistrelli europei. PLoS ONE, 7(1), e30388. due:10.1371/journal.pone.0030388

La notizia principale in due settimane.

Mercoledì 7 Dicembre 2011

Speriamo di pubblicare una sintesi delle notizie di pipistrelli nel mondo ogni due settimane.

La buona notizia, ilConcorso fotografico risultati per l'anno del pipistrello sono online. Congratulazioni a tutti i vincitori ! Di più, Abbiamo messo insieme una piccola selezione di articoli:

- La natura in un documento che conferma il legame tra il fungo Geomyces destructans e sindrome del naso bianco (“Nose Syndrome Bianco”) [link al riassunto in inglese].

- un documento in Nature Communications studiare speciazione in il più piccolo mammifero del mondo, il pipistrello calabrone (cf. dettagliato articolo di ieri su questa carta Chiroblog), [scarica il PDF],

- un documento sulla Natterer di Murine(Myotis nattereri), un complesso che comprende 4 specie del Paleartico occidentale ! [link al riassunto in inglese]

- un secondo documento sulle specie complesso del Natterer Murine che mostra la distribuzione di queste nuove specie scoperte in Francia e l'eventuale presenza di specie nuove per la scienza in Corsica [scarica il PDF],

- un documento sulla effetto di una strada sull'attività e la diversità di Chiros [link al riassunto in inglese].

Questo è tutto per oggi, presto per un nuovo elemento la notizia di pipistrelli !

Per la squadra Chiroblog,

Yann, Meriadeg & Seb

PS : Per gli utenti di Twitter, Appuntamento alle @ bat_yann, Funzione @ @ Henlakebats e chiropratici SmileyBat per ulteriori informazioni !

Sulla origine delle specie : più piccolo mammifero del mondo, il pipistrello calabrone svela i meccanismi di speciazione

Martedì 6 Dicembre 2011

Una delle principali sfide nel campo della biologia è capire come le specie si evolvono. Oggi, circa 150 anni dopo la pubblicazione di Darwin “Sulla origine delle specie” davvero continuano a non capire il processo di speciazione. Ciò è dovuto al fatto che gli studi più classici di speciazione sono basati su specie che divergono, e pertanto, ci speculano indietro nel tempo per dedurre le cause della speciazione. Infatti, due dei migliori esempi più noti di “speciazione simpatrica”, ciclidi del lago Vittoria e pipistrelli ferro di cavallo di Wallace, suggeriscono che l'ecologia sensoriale (come un animale percepisce e interagisce con l'ambiente) svolge un ruolo importante nel processo di speciazione, che le popolazioni geograficamente isolate o non. Tuttavia, in tali studi, i ricercatori sono stati in grado di studiare i fattori che intervengono nelle prime fasi del processo di speciazione.

Bumblebee pipistrelli, più piccolo mammifero del mondo; foto scattata in Birmania 2006 dalla squadra sul campo.

«Il nostro studio è unico nel senso che cattura la speciazione “in azione” nelle popolazioni che attualmente divergono ecologicamente. Queste popolazioni sono quelli delle più piccolo mammifero del mondo, il pipistrello calabrone (Craseonycteris thonglongyai) si trova solo in Thailandia e Birmania. Queste persone rappresentano un esperimento naturale unico che permette di “cattura” il processo evolutivo ha una scala temporale per identificare la natura di questi processi che portano a speciazione natura” afferma il dottor Emma Teeling che ha guidato il team di ricerca nel corso di questo studio.

Studiando il processo di speciazione primi a diverse scale temporali evolutive, questo studio mostra che nel caso di questa specie, un flusso gene limitata, derivante dalla distanza geografica, è necessario per promuovere sensoriale speciazione ecologica.

Per fare, abbiamo esaminato la struttura spaziale, struttura genetica e le caratteristiche ecologiche tra sensoriale e nel giro di soli due popolazioni conosciute il più piccolo mammifero del mondo, il pipistrello calabrone (Craseonycteris thonglongyai). Abbiamo generato e raccolto un grande insieme di dati molecolari, Spettacolo ecologico e acustico che la distanza geografica gioca un ruolo determinante nel limitare il flusso genico, piuttosto che la divergenza di ecolocalizzazione. I nostri risultati supportano l'idea che gli atti ecologia sensoriali come un meccanismo di rafforzamento del processo di speciazione piuttosto che essere il driver principale, come è stato precedentemente assunto in altri ben documentato empirica. I nostri risultati sollevano la questione se effettivamente si verifica speciazione simpatrica, o se un certo livello di isolamento geografico e il flusso genico così limitato è comunque tenuta ad avviare il processo di speciazione », ha detto il Dott. Sebastien Puechmaille, autore principale dello studio.

Un altro interessante risultato di questo studio è l'identificazione di un gene “ecolocalizzazione” (RBP-J) mostrando segni di selezione divergente corrispondenti alla divergenza di ecolocalizzazione in questa popolazione thailandese. Questa è la prima associazione di questo gene identificato con capacità di ecolocalizzazione. Questo gene è coinvolto nella formazione di cellule cigliate nella coclea (organo recettore suoni nell'orecchio interno). Come pipistrelli utilizzare le frequenze più alte (maggiore 200 kHz) di tutti i mammiferi, il loro sistema uditivo, in particolare le cellule ciliate dell'organo del Corti, in cui viene ricevuto il suono amplificato e, ha bisogno di adattamenti speciali.

«Mostriamo anche che la concorrenza interspecifica con altre specie di pipistrelli, Myotis siligorensis, è probabilmente la causa di localizzazione sensoriale, a differenza deriva casuale o fattori abiotici come temperatura e umidità», ha detto il Dott. Sebastien Puechmaille.

Dal punto di vista della conservazione, questo è il primo studio per indagare la struttura della popolazione e la storia evolutiva dei più piccoli mammiferi del mondo, il pipistrello calabrone, Craseonycteris thonglongyai. “Questa specie di pipistrello è rara e in via di estinzione carismatico, limitato a una regione di 2000 km2 nella zona di confine tra la Thailandia e la Birmania ed è considerata una delle dieci specie evolutivamente distinte a livello mondiale in pericolo (Evolutionary Distinct e Globally Endangered, BORDO, specie)“, ha detto il Dott. Emma Teeling.

Filogenetica analizza dei marcatori trasmessi attraverso la linea materna, paterno, o ereditato da entrambi i genitori e dati ecologici dimostrare la presenza di due specie di pipistrelli bumblebee, uno in Thailandia e Birmania, che sono separati ci sono circa 0,4 milioni di anni. Capacità di dispersione limitato di individui in combinazione con una gamma molto limitata (meno 2000 km2) suggeriscono che entrambe le specie sono minacciate e richiedono piani di gestione e conservazione distinti.

Il documento è pubblicato 6 Dicembre 2011 è così disponibile gratuitamente nelle comunicazioni della rivista Nature (http://www.nature.com/ncomms/journal/v2/n12/pdf/ncomms1582.pdf). Il riferimento del presente documento è :

Puechmaille, S.J., Ar Gouilh, M., Piyapan, P., Yokubol, M., Khin Mie Mie, Bates, P.J.J., Satasook, C., Tin Nwe, Si Si Bu Hla, Mackie, I.J., Petit E.J., e Teeling E.C. (2011). L'evoluzione di divergenza sensoriale nel contesto di flusso genico limitata nel pipistrello calabrone. Nature Communications 2, 573, DOI: 10.1038/ncomms1582. [L'evoluzione di discrepanza sensoriale nel contesto di flusso genico limitata nel pipistrello calabrone].

Questo lavoro rappresenta un progetto irlandese, IFC-finanziato, una Fondazione irlandese per la Scienza e assegnato al Dr.. Emma Teeling. Questo progetto è una collaborazione tra i ricercatori in Francia, Thailandia nel, Il Birmanie, Regno Unito e in Irlanda per affrontare una questione fondamentale in biologia con implicazioni per la conservazione.

Seb.

Una nuova famiglia di pipistrelli : I Cistugidae !

Giovedi 10 Marzo 2011

Riprendendo il nostro ultimo articolo “Una classificazione in moto perpetuo” Riportiamo qui la creazione di una nuova famiglia di pipistrelli proposto da scienziati americani e svizzeri: il Cistugidae del sottordine Yangochiroptera. Due specie del Sud Africa, Cistugo seabrae e Cistugo lesueuri, sono interessati. Essi sono stati precedentemente classificati nella famiglia Vespertilionidae, a livello sub-genere del genere allora Cistugo Myotis.Uno studio pubblicato nel 2010 propone la definizione della nuova famiglia di Cistugidae classificare tale Cistugo. La datazione molecolare, effettuata sui dati di mancanza et al. (2010) sul DNA mitocondriale e nucleare ha una data di esordio di questa famiglia di nuovo a circa 34 milioni di anni. Secondo questo stesso studio, l'origine Cistugidae precedono il successivo effettivo di parentela, ilVespertilionidae che sarebbe derivata non 27 milioni di anni. Porta a questa nuova famiglia 20 il numero di famiglie di pipistrelli, 6 in sottordine Yinpterochiroptera e 14 in sottordine Yangochiroptera.

A comunicato stampa è disponibile presso il Museo di Ginevra, dove lavora Manuel Ruedi, uno dei coautori di questo articolo proporre questa nuova famiglia.

la chauve-souris de Seabra (Cistugo seabrai), une des deux seules espèces appartenant à la nouvelle famille des Cistugidés. ©Muséum de Genève; photo: Manuel Ruedi

Il pipistrello Seabra (Cistugo seabrai), uno degli unici due specie appartenenti alla nuova famiglia di Cistugidés. © Museo di Ginevra; foto: Manuel Ruedi

Yann & Meriadeg

Citazione

Mancanza, J. B., Il. P. Roehrs, C. E. Stanley, M. Ruedi, e R. A. Van den Bussche. 2010. Filogenesi molecolare di Myotis indicano familiare livello divergenza per il genere Cistugo (Chiroptera). Journal of Mammalogy 91:976-992.

Protetto: ECOLOGICA RELAZIONI VIRUS / CHIROPTERES

Martedì 11 Novembre 2008

Questo post è protetto da password. Per vederlo, inserisci la tua password qui sotto:

Conservazione in RNA

Domenica 3 Agosto 2008

Ho sentito che era meglio tenere i campioni in RNAlater -20 o -80 ° C per evitare la degradazione dell'RNA piuttosto che a temperatura ambiente. Qual è la migliore tecnica ?