Asam nukleat « Chiroblog

Archive pour la catégorie ‘Acides nucléiques

Evolusi konvergensi (4) : jusque dans les molécules !

Sabtu 27 April 2013

Un quatrième épisode vient s’ajouter à cette série dédiée aux convergences évolutives. Dans les épisodes précédents, nous avons vu que les convergences sont des acquisitions parallèles de structures similaires dans des lignées évolutives différentes mais soumises à des conditions environnementales équivalentes. Nous avons vu des exemples de convergences écomorphologiques (écologie + morfologi) comme chez les chauves-souris pêcheuses, itu Myotis et chez les chauves-souris nectarivores de la famille des Phyllostomidae. Plus impressionnant encore, les convergences peuvent exister au niveau moléculaire ! C’est ce qu’ont découvert des chercheurs américains et chinois chez les Cétacés (plus précisément chez les baleines à dents ou Odontocètes) et les Microchiroptères*, qui utilisent les ultrasons par le mécanisme d’echolocation (= biosonar) pour se diriger et chasser. Le gène codant pour la prestine, protéine utilisée pour l’audition et l’amplification des sons, montre chez ces animaux un mécanisme moléculaire très similaire (Li et al. 2008 & 2010, Jones 2010, Liu et al. 2010).

Jadi, les exemples de convergences se multiplient dans la littérature et la poursuite des travaux dans ce domaine promet encore de nombreuses découvertes tout aussi intéressantes sur l’évolution de la vie.

Yann pour le Chiroblog

Microchiroptères* : Deux sous-ordres étaient classiquement admis : itu Microchiroptères (de petite taille relative et capables d’écholocation) et les Mégachiroptères (de grande taille relative ; Dobson 1875). Récemment, l’ordre a été redécoupé en deux nouveaux sous-ordres pour rompre la paraphylie des Microchiroptères : itu Yinpterochiroptera et les Yangochiroptera (Teeling et al. 2002 ; Teeling et al. 2005).

Referensi :

Jones, G. (2010). Molecular evolution: gene convergence in echolocating mammals. Current biology : CB, 20(2), R62–4. dua:10.1016/j.cub.2009.11.059

Li, G., Wang, J., Rossiter, S. J., Jones, G., Cotton, J. A., & Zhang, S. (2008). The hearing gene Prestin reunites echolocating bats. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105(37), 13959–64. dua:10.1073/pnas.0802097105

Li, Y., Liu, Z., Shi, P., & Zhang, J. (2010). The hearing gene Prestin unites echolocating bats and whales. Current biology : CB, 20(2), R55–6. dua:10.1016/j.cub.2009.11.042

Liu, Y., Cotton, J. A., Shen, B., Han, X., Rossiter, S. J., & Zhang, S. (2010). Convergent sequence evolution between echolocating bats and dolphins. Current biology : CB, 20(2), R53–4. dua:10.1016/j.cub.2009.11.058

Teeling, E. C., Itu. Madsen, R. Sebuah. Van den Bussche, W. Di. de Jong, M. J. Stanhope et M. S. Springer. 2002. Microbat paraphyly and the convergent evolution of a key innovation in Old World rhinolophoid microbats. Prosiding National Academy of Sciences, Amerika Serikat 99: 1431-1436.

Teeling, E. C., M. S. Springer, O. Madsen, P. Bates, J. O’Brien S et W. J. Murphy. 2005. A molecular phylogeny for bats illuminates biogeography and the fossil record. Science 307: 580-584.

Berita bulan Oktober 2012

Jumat 5 Oktober 2012

Une nouvelle sélection d’articles scientifiques pour ce mois d’Octobre 2012 :

- Une article qui résoud un mystère de 65 ans durant lesquels on ne connaissait qu’un seul exemplaire de Paracoelops megalotis, une petite chauve-souris de la famille des Hipposidéridés collectée en 1947 au Vietnam. Personne depuis n’avait jamais réussi à capturer un autre exemplaire de l’espèce qui représente un genre unique. Une re-examination du spécimen type de Paracoelops megalotis a permis de déceller des erreurs importantes dans la description et sa comparaison avec des chauves-souris récemment capturées au Vietnam a permit de conclure que l’espèce n’était autre que Hipposideros pomona, une espèce relativement fréquente en Asie du Sud-Est [download PDF].

- Sebuah filogeni baru dari Murine (Myotis) d’Amérique Centrale et Tropicale a été publiée dans la revue Plos One
[download PDF]. Sur la base de critères moléculaires, trois nouvelles lignées nt été décrites, elle s’ajoutent aux 15 déjà connues.

- Une publication parue dans le Canadian Journal of Zoology met en évidence l’hybridisation possible
entre les espèces Pipistrellus pipistrellus dan P. pygmaeus [link ke ringkasan].

- Un article qui met en évidence l’apprentissage de signaux acoustiques spécifiques aux groupes chez l’Emballonuridae Saccopteryx bilineata, utiles pour la reconnaissance entre individus [link ke ringkasan]

Para Chiroblog tim

Referensi


- Thong V.D., Dietz C., DENZ A., Bates P.J.J., Puechmaille S.J., Callou C. Schnitzler dan H-U. (2012). Resolving a mammal mystery: the identity of Paracoelops megalotis (Chiroptera: Hipposideridae). Zootaxa, 3505, 75-85.

- Knörnschild, M., Nagy, M., Metz, M., Mayer, F., & von Helversen, Itu. (2012). Learned vocal group signatures in the polygynous bat Saccopteryx bilineata. Animal Behaviour, 84(4), 761–769. dua:10.1016/j.anbehav.2012.06.029

- Larsen RJ, Knapp MC, Genoways HH, Khan FAA, Larsen PA, dkk. (2012) Genetic Diversity of Neotropical Myotis (Chiroptera: Vespertilionidae) with an Emphasis on South American Species. PLoS ONE 7(10): e46578. dua:10.1371/journal.pone.0046578

- Sztencel-Jabłonka, A., & Bogdanowicz, Di. (2012). Population genetics study of common (Pipistrellus pipistrellus ) and soprano (Pipistrellus pygmaeus) pipistrelle bats from central Europe suggests interspecific hybridization. Canadian Journal of Zoology, 90(10), 1251–1260. dua:10.1139/z2012-092

Berita Mei 2012

Selasa 15 Mei 2012

Sebuah pilihan baru dari artikel ilmiah untuk bulan Mei 2012 :

- Sebuah artikel yang diterbitkan di PLoS One yang mengembangkan penggunaan minibarcodes DNA
untuk mendeteksi pola makan gunung murine Plecotus macrobullaris [link ke abstrak dan PDF].

- Sebuah klasifikasi baru dari Dunia keluarga Emballonuridae Lama
diterbitkan dalam Filogenetik Molekuler dan Evolusi [link ke ringkasan].

- Sebuah spesies baru Kelamin Hipposideros baru saja dijelaskan dan namanya, Hipposideros griffini rend penghormatan au Professeur Donald Redfield Griffin (1915-2003) yang dimulai penelitian tentang ekolokasi pada kelelawar [link ke ringkasan].

-La classification du groupe ‘turpis’ di Hipposideros hanya ditinjau dengan dua subspesies kunci diangkat ke spesies penuh dan satu subspesies baru dijelaskan [link ke PDF].

- Sebuah artikel yang diterbitkan di Alam komunikasi menggambarkan berbagaiParamyxoviridaepada kelelawar (dan tikus) [mendownload komunikasi]. Seperti keluarga virus lainnya (ituCoronaviridae misalnya) itu Paramyxoviridae, terdiri dari genera yang Henipavirus (Virus Nipah dan Hendra), tetapi jugaRubulavirus (gondok virus: “penyakit gondok”) danMorbillivirus (virus campak, Anda virus demam-dari-kecil-ruminansia) telah terdiversifikasi dalam beberapa kelompok mamalia dan terutama dalam kelompok besar seperti tikus dan kelelawar. Kami akan segera membahas lebih lanjut tentang artikel ini di posting masa depan.

Jika tidak, kami mengingatkan Anda 3th pertemuan internasional kelelawar Berlin dan Bat Distribusi Vieweryang memungkinkan untuk melihat peta sebaran spesies kelelawar di seluruh dunia.

Para Chiroblog tim

Referensi

- Alberdi, A., Garin, I., Aizpurua, O., & Aihartza, J. (2012). Para Ekologi mencari makan dari macrobullaris Long-eared Bat Gunung Plecotus Terungkap dengan DNA Mini-Barcode. PLoS ONE, 7(4), e35692.

- Ruedi, M., Friedli-Weyeneth, N., Teeling, Itu. C., Puechmaille, S. J., & Goodman, S. M. (2012). Biogeografi dari Old World emballonurine kelelawar (Chiroptera: Emballonuridae) disimpulkan dengan DNA mitokondria dan nuklir. Molekul filogenetik dan evolusi, 64(1), 211-204. dua:10.1016/j.ympev.2012.03.019

- Tali kulit, V.D., Puechmaille S.J., DENZ A., Csorba G., Dietz C., Bates P.J.J., Teeling E.C. Schnitzler dan H-U. (2012). Sebuah spesies baru Hipposideros (Chiroptera: Hipposideridae) dari Vietnam. Jurnal ilmu pengetahui binatang menyusui, 93(1), 1-11.

-Tali kulit, V.D., Puechmaille S.J., DENZ A., Bates P.J.J., Dietz C., Csorba G., Soisook P., Teeling E.C., Matsumura S., Furey N. Schnitzler dan H-U. (2012). Sistematika dari Hipposideros turpis kompleks dengan deskripsi suatu subspesies baru dari Vietnam. Mamalia Tinjauan, 42(2), 166-192.

- Drexler, J. F., Corman, Di. M., Penggiling, M. A., Maganga, G. D., Vallo, P., Binger, T., Gloza-RausF., F., dkk. (2012). Kelelawar tuan mamalia paramyxoviruses utama. Alam Komunikasi, 3, 796.

Berita Maret 2012

Senin 19 Maret 2012

Sebuah pilihan baru dari artikel ilmiah untuk bulan Maret 2012 :

- Sebuah klasifikasi baru dari Molossinae subfamili (Molossidae) terdiri dari analisis
Karakter Molekuler, baru saja diterbitkan dalam Jurnal ilmu pengetahui binatang menyusui [download PDF].

- Sebuah filogeni baru dari Murine (Myotis) Karibia diterbitkan dalam jurnal Mamalia Biologi
[link ke ringkasan]. Berdasarkan morfologi dan molekuler, spesies endemik ketiga ke Karibia ditemukan.

- Sebuah artikel yang diterbitkan dalam PLoS One laporan tentang penggunaan bahan kimia, les isotop kandang,
sebagai metode untuk memprediksi lokasi pengembangbiakan Eropa kelelawar
[link ke abstrak dan PDF].

Para Chiroblog tim

Referensi

- Ammerman, Itu. K., Lee, D. N., & Tips, T. M. (2012). Pertama filogenetik molekuler wawasan ke dalam evolusi bebas ekor kelelawar di Molossinae subfamili (Molossidae, Chiroptera). Jurnal ilmu pengetahui binatang menyusui, 93(1), 12-28. dua:10.1644/11-MAMM-A-103.1

- Larsen, R. J., Larsen, P. A., Genoways, H. H., Catzeflis, F. M., Geluso, K., Kwiecinski, G. G., Pedersen, S. C., dkk. (2012). Evolusi sejarah spesies Karibia Myotis, dengan bukti Antilla Lesser ketiga endemik. Mamalia Biologi – Jurnal ilmu pengetahui binatang menyusui, 77(2), 124-134. dua:10.1016/j.mambio.2011.11.003

- Popa-Lisseanu, Sebuah. G., Soergel, K., Luckner, A., Wassenaar, Itu. I., Ibanez, C., Kramer-Schadt, S., Ciechanowski, M., dkk. (2012). Pendekatan triple-isotop untuk memprediksi asal-usul peternakan dari Eropa kelelawar. PLoS ONE, 7(1), e30388. dua:10.1371/journal.pone.0030388

Kabar utama dalam setiap dua minggu.

Rabu 7 Desember 2011

Kami berharap untuk mengeluarkan ringkasan berita dari kelelawar di dunia setiap dua minggu.

Kabar baiknya, ituFoto kontes hasil untuk tahun kelelawar sedang online. Selamat kepada semua pemenang ! Lebih, Kami telah mengumpulkan pilihan kecil item:

- Alam dalam makalah mengkonfirmasikan hubungan antara jamur Geomyces destructans Hidung dan Sindrom Putih (“Putih Hidung Syndrome”) [link ke ringkasan bahasa Inggris].

- makalah di Nature Communications mempelajari spesiasi dalam mamalia terkecil di dunia, kelelawar lebah (cf. artikel kemarin tentang tulisan ini di Chiroblog rinci), [download PDF],

- sebuah makalah tentang Natterer dari Murine(Myotis nattereri), sebuah kompleks yang akan mencakup 4 spesies di Palearctic Barat ! [link ke ringkasan bahasa Inggris]

- kertas kedua pada spesies kompleks Natterer Murine yang menunjukkan distribusi dari spesies baru yang ditemukan di Prancis dan kemungkinan adanya spesies baru bagi ilmu pengetahuan di Corsica [download PDF],

- makalah tentang pengaruh jalan raya pada aktivitas dan keragaman Chiros [link ke ringkasan bahasa Inggris].

Itu saja untuk hari ini, segera untuk item baru pada berita dari kelelawar !

Untuk Chiroblog tim,

Yann, Meriadeg & Seb

PS : Untuk pengguna Twitter, Bertemu di @ bat_yann, @ @ Henlakebats dan ahli tulang SmileyBat untuk info lebih lanjut !

On the Origin of Species : mamalia terkecil di dunia, kelelawar lebah membongkar mekanisme spesiasi

Selasa 6 Desember 2011

Tantangan utama dalam biologi adalah untuk memahami bagaimana spesies berevolusi. Hari ini, tentang 150 tahun setelah penerbitan Darwin “On the Origin of Species” kita benar-benar masih tidak mengerti proses spesiasi. Hal ini sebagian disebabkan oleh kenyataan bahwa kebanyakan studi klasik spesiasi didasarkan pada spesies yang telah menyimpang, dan karena itu, kami berspekulasi kembali pada waktunya untuk menyimpulkan penyebab spesiasi. Memang, dua contoh yang paling terkenal dari “sympatric spesiasi”, cichlids Danau Victoria dan kelelawar tapal kuda Wallace, menunjukkan bahwa ekologi sensorik (bagaimana binatang merasakan dan berinteraksi dengan lingkungannya) memainkan peran utama dalam proses spesiasi, bahwa populasi secara geografis terisolasi atau tidak. Namun, dalam studi ini, peneliti tidak dapat mempelajari faktor yang terlibat pada tahap awal dari proses spesiasi.

Bumblebee kelelawar, terkecil mamalia di dunia; foto diambil di Burma 2006 oleh tim lapangan.

«Penelitian kami adalah unik dalam arti bahwa ia menangkap spesiasi yang “sedang beraksi” pada populasi yang saat ini menyimpang secara ekologis. Populasi ini adalah pendapat dari mamalia terkecil di dunia, kelelawar lebah (Craseonycteris thonglongyai) hanya ditemukan di Thailand dan Burma. Orang-orang ini merupakan eksperimen alam yang unik yang memungkinkan “menangkap” proses evolusi memiliki skala waktu untuk mengidentifikasi sifat dari proses-proses yang mengakibatkan spesiasi alam” kata Dr Emma Teeling yang memimpin tim penelitian selama penelitian ini.

Dengan mempelajari proses spesiasi awal pada berbagai skala waktu evolusi, studi ini menunjukkan bahwa dalam kasus spesies ini, aliran gen terbatas, yang dihasilkan dari jarak geografis, diperlukan untuk mempromosikan sensorik spesiasi ekologi.

Untuk melakukan, kami memeriksa tata ruang, genetik struktur dan sifat-sifat ekologis antara sensorik dan dalam waktu hanya dua populasi yang diketahui dari mamalia terkecil di dunia, kelelawar lebah (Craseonycteris thonglongyai). Kami menghasilkan dan mengumpulkan satu set data yang besar molekul, Ekologi dan akustik menunjukkan bahwa jarak geografis memainkan peran penting dalam membatasi aliran gen daripada perbedaan dari echolocation. Hasil kami mendukung gagasan bahwa sensorik ekologi bertindak sebagai mekanisme penguatan dalam proses spesiasi daripada menjadi pendorong utama seperti yang diperkirakan sebelumnya diasumsikan dalam lain yang terdokumentasi dengan baik empiris. Hasil kami mengangkat pertanyaan apakah spesiasi sympatric benar-benar terjadi, atau jika beberapa tingkat isolasi geografis dan aliran gen sehingga terbatas masih diperlukan untuk memulai proses spesiasi », kata Dr Sebastien Puechmaille, penulis utama studi tersebut.

Temuan lain yang menarik dari studi ini adalah identifikasi gen “echolocation” (RBP-J) menunjukkan tanda-tanda seleksi yang berbeda sesuai dengan perbedaan dari echolocation pada populasi Thailand. Ini adalah asosiasi pertama dari gen diidentifikasi dengan kapasitas echolocation. Gen ini terlibat dalam pembentukan sel-sel rambut di koklea (organ reseptor terdengar di telinga dalam). Seperti kelelawar menggunakan frekuensi tertinggi (di atas 200 kHz) dari semua mamalia, mereka pendengaran sistem, terutama sel-sel rambut di organ Corti, di mana suara diterima dan diperkuat, membutuhkan adaptasi khusus.

«Kami juga menunjukkan bahwa kompetisi interspesifik dengan spesies kelelawar, Myotis siligorensis, mungkin adalah penyebab lokalisasi sensorik, sebagai lawan melayang acak atau faktor abiotik seperti suhu dan kelembaban», kata Dr Sebastien Puechmaille.

Dari sudut pandang konservasi, ini adalah studi pertama untuk menyelidiki struktur populasi dan sejarah evolusi mamalia terkecil di dunia, kelelawar lebah, Craseonycteris thonglongyai. “Ini spesies kelelawar langka dan terancam punah karismatik, terbatas pada wilayah 2000 km2 di daerah perbatasan antara Thailand dan Burma dan dianggap salah satu dari sepuluh spesies evolusioner yang berbeda dan secara global terancam punah (Berbeda evolusi dan global Endangered, EDGE, jenis)“, kata Dr Emma Teeling.

Filogenetik menganalisa penanda ditularkan melalui garis ibu, ayah, atau diwariskan oleh kedua orang tua dan data ekologi menunjukkan adanya dua spesies kelelawar lebah, satu di Thailand dan Burma, yang dipisahkan ada sekitar 0,4 juta tahun. Terbatas penyebaran kemampuan individu dikombinasikan dengan rentang yang sangat terbatas (kurang 2000 km2) menunjukkan bahwa kedua spesies terancam dan memerlukan rencana pengelolaan dan konservasi yang berbeda.

Tulisan ini diterbitkan 6 Desember 2011 sehingga tersedia gratis di jurnal Nature Komunikasi (http://www.nature.com/ncomms/journal/v2/n12/pdf/ncomms1582.pdf). Referensi dari makalah ini adalah :

Puechmaille, S.J., Ar Gouilh, M., Piyapan, P., Yokubol, M., Khin Mie Mie, Bates, P.J.J., Satasook, C., Tin NWE, Si Si Hla Bu, Mackie, I.J., Kecil E.J., dan Teeling E.C. (2011). The evolution of sensory divergence in the context of limited gene flow in the bumblebee bat. Alam Komunikasi 2, 573, DOI: 10.1038/ncomms1582. [L'évoluEvolusi perbedaan indrawi dalam konteks aliran gen terbatas di kelelawar lebah

Karya ini merupakan sebuah proyek Irlandia, IFC-dibiayai, sebuah Yayasan Irlandia untuk Sains dan diberikan kepada Dr. Emma Teeling. Proyek ini merupakan kolaborasi antara peneliti di Perancis, Thailand, dan Birmanie, Inggris dan Irlandia untuk mengatasi pertanyaan mendasar dalam biologi dengan implikasi untuk konservasi.

Seb.

Sebuah keluarga baru dari kelelawar : yang Cistugidae !

Kamis 10 Maret 2011

Mengulangi artikel terakhir kami “Sebuah klasifikasi dalam gerakan abadi” Di sini dilaporkan penciptaan keluarga baru dari kelelawar diusulkan oleh ilmuwan Amerika dan Swiss: itu Cistugidae dari subordo ini Yangochiroptera. Dua spesies dari Afrika Selatan, Seabrae Cistugo dan Cistugo lesueuri, prihatin. Mereka sebelumnya diklasifikasikan dalam keluarga Vespertilionidae, di sub-genre dalam genre kemudian Cistugo Myotis.Sebuah studi yang diterbitkan di 2010 mengusulkan definisi keluarga baru Cistugidae untuk mengklasifikasikan seperti Cistugo. Penanggalan molekuler dilakukan pada data Kurangnya dkk. (2010) pada DNA mitokondria dan nuklir memiliki tanggal onset dari keluarga ini kembali ke sekitar 34 juta tahun. Menurut penelitian yang sama, asal Cistugidae mendahului berikutnya sebenarnya keluarga terdekat, ituVespertilionidae yang akan muncul ada 27 juta tahun. Pintu ini keluarga baru 20 jumlah keluarga kelelawar, 6 dalam subordo ini Yinpterochiroptera dan 14 dalam subordo ini Yangochiroptera.

Sebuah tekan rilis tersedia di Museum Jenewa di mana bekerja Manuel Ruedi, salah satu rekan penulis dari artikel ini mengusulkan keluarga baru.

la chauve-souris de Seabra (Cistugo seabrai), une des deux seules espèces appartenant à la nouvelle famille des Cistugidés. ©Muséum de Genève; photo: Manuel Ruedi

Para kelelawar Seabra (Cistugo seabrai), salah satu dari hanya dua spesies yang termasuk keluarga baru Cistugidés. © Museum Jenewa; foto: Manuel Ruedi

Yann & Meriadeg

Kutipan

Kekurangan, J. B., Z. P. Roehrs, C. Itu. Stanley, M. Ruedi, dan R. Sebuah. Van den Bussche. 2010. Molekul filogenetik dari Myotis menunjukkan tingkat perbedaan keluarga dengan genus Cistugo (Chiroptera). Jurnal ilmu pengetahui binatang menyusui 91:976-992.

Terlindung: EKOLOGI HUBUNGAN VIRUS / CHIROPTERES

Selasa 11 November 2008

Posting ini dilindungi kata sandi. Untuk melihatnya mohon masukkan sandi Anda di bawah ini:

Konservasi pada RNA

Minggu 3 Agustus 2008

Saya mendengar bahwa lebih baik untuk menjaga sampel dalam RNAlater -20 atau -80 ° C untuk menghindari degradasi RNA dan bukan pada suhu kamar. Apa teknik terbaik ?